Постои култ, каде што младите момчиња да научите уметноста на нинџата. Ова е многу тежок пат, кој бара не само добра физичка подготовка, но исто така и сила на духот. Да се во согласност со сите закони од кодот нинџа, не може секој да. Нинџа Boy игра, ќе се запознаат со Кун, момче кое одлучил да го посвети својот живот на код нинџа. Вчера, беше нападнат во неговото училиште. Напаѓачите не се луѓе, а некои многу чудни чудовишта. Тие украле сите богатства на нинџите училиште. Сега, само Кун може да закрепне украдени, но тој треба вашата помош. Мора да му помогнеме така што тој, со минималниот број на потези, го убие чудовишта и богатства се врати.
