Мечка Бањо, заедно со неговата сестра, живее во длабочините на шумата. Како еден ден нашиот лик се разбуди и откри дека неговата помлада сестра недостасува. Сега во играта Banjo-Kazooie, ние ќе му помогне да ја најде. За помош, нашиот лик се сврте кон магичната птица Казу. По магичен ритуал, таа ја фати патеката и полета по неа. Сега ќе се кандидира херој ќе мора да се кандидира по неа, без заостанување. Бидете внимателни за начинот на кој ќе имате замки и за возење, херојот ќе мора да ги присили да скокаат над нив. Понекогаш може да наидете на различни агресивни чудовишта и ќе мора да ги уништите.
