Нинџа желки се вратија од нивната следна задача и откриле дека нивниот наставник Сплинтер недостасува. Во Менхетен во последно време немирен, имаше многу мутанти и некој зад нив. Тимот желки веќе спречи неколку злобни планови и невидливиот непријател одлучи да се одмазди сурово со киднапирање на нивните сенсеи. Леонардо е господар на кадан борби, лидерот на тимот Рафаел вешто се справува со Сајес, Донетелло користи специјален персонал, а Микеланџело сака nunchaku. Тие ќе бидат помогнати до април, таа мајсторски поседува зелена магија за бејзбол.
