Во далечна иднина, научниците научиле да ги намалуваат предметите во микроскопски големини. Денес во играта Spore Hunter, тие решија да го испратат пилотот на специјален авион за да го истражат микро светот. Вашиот херој ќе мора да лета по одредена рута и да го истражува овој свет. Суштества што се состојат од спори ќе го нападнат нашиот херој. Внесените броеви ќе бидат видливи во нив. Тие значат колку хитови треба да ги направите на суштеството за да го уништите. Вие умно маневрирање на вашиот брод ќе пука во него од вашето оружје и ќе ги уништи спорите.
