Нинџа е херој на многу игри, а во Carrot Ninja многу личи на обичен морков. Така е - ова е нинџа од морков и тој има намера да стигне до следната пагода на секое ниво. Ова е целта на херојот. Помогнете му вешто да скокне на платформите, да собере парички ако е можно. Понатаму на нивоата ќе има дополнителни пречки во форма на роботски ежи и други неволји што треба да се прескокнат. Во горниот десен агол ќе го најдете бројот на животи на моркови во форма на зелени листови. Штом ќе ги искористите, нивото ќе треба да се рестартира во Carrot Ninja.
