Принцезата Пич е повторно киднапирана, Боусер не може да се смири и време е да се пензионира, но сепак таму, дајте му убавина. Марио треба да излезе на патот, а тој исто така не е првата свежина. За прв пат, водоинсталатерот се сомневал во неговите способности и решил да го покани Соник да помогне, знаејќи како може брзо да трча и да скока високо. Во меѓувреме, додека Sonic пристигнува, можете да го контролирате Марио и да му помогнете да собира парички и да скокне врз послушниците на Bowser. Потоа можете да се префрлите на Sonic, но тој ќе мора да собира прстени, но и двата херои имаат иста цел - да ја спасат принцезата во Super Mario и Sonic.