Најразличните универзуми, еден по друг, се заробени од чудовиштата Скибиди тоалети. Марио внимателно ги следи вестите и разбира дека порано или подоцна ќе стигнат до Кралството на печурките. Тој реши да го спречи ова и отиде во заробените светови за да ги уништи тамошните негативци. Тој одлучи на ова со причина, нашиот херој служеше во интелигенција долго време, иако малку луѓе знаат за тоа и ги има сите потребни вештини. Херојот ќе се најде на територијата што ја заробиле чудовиштата Скибиди. Водоводџија со вештини за шпионирање мора да ја истражува областа и да се обиде да направи сè што е можно потивко. Сепак, не може да се постигне целосна тишина. Контролирајте го неговото движење со стрелките. На патот ќе има пречки што треба да ги прескокнете. Судирите се неизбежни и вреди да се подготви однапред за да се нападне од најзгодната позиција. Твојот нема да може да користи оружје, бидејќи гласните истрели ќе привлечат непотребно внимание кон неговата личност. Вклучете се во борба со непријателот, удирајте со копчето Z и одете напред во тоалетот Super Spy Mario VS Skibidi. Секое завршено ниво ќе биде наградено и ќе можете да го зајакнете Марио.
