Животот во Кралството на печурките повторно е нарушен поради киднапирањето на принцезата Пич. Баузер не може да се смири и не може да смисли ништо ново освен киднапирање на принцезата. Марио во Super Mario Flash ќе тргне на патување за да спаси девојка, ова не му е прв пат, а вие имате причина повторно да станете учесник во забавна авантура. Водете го Марио низ платформите, скокајќи на зли печурки и желки. Пронајдете го големиот волшебен агарик за мува што ќе го претвори водоинсталатерот во Супер Марио. Покрај тоа, можете да најдете магичен цвет на платформите, кој исто така ќе го зајакне херојот и ќе му даде сила во Super Mario Flash.
